FEMISE bénéfice du financement de différents bailleurs de fonds, parmi lesquels:
La Commission Européene et le programme Europe Aid sont considérés les principaux bailleurs de fonds du FEMISE et ont toujours soutenu ses activités depuis 1998.
D’autres bailleurs de fonds ont contribué aux activités de FEMISE comme:
FEMISE reçoit des fonds de la Banque européenne d’investissement (BEI) à travers le programme FEMIP par une Memorendum d’accord signé avec le FEMISE depuis 2007
Récemment ajouté à la liste des bailleurs de fonds est l’Agence Française de Développement (AFD), qui a soutenu des activités du FEMISE en 2014.
FEMISE is aussi partenaire avec:
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D’autres bailleurs de fonds et des partenaires participent a des projets thématiques comme: programme de la Commission européenne FP7, la Banque mondiale, le World Forum … etc
FEMISE continue à être ouvert aux possibilités de partenariat et de financement qui lui permettront d’augementer ses activités et de développer et promouvoir la recherche sur la région Euromed.